Được đánh giá là một trong những trung vệ hàng đầu Việt Nam nhưng Quế Ngọc Hải nhiều lần có những tình huống phòng ngự thiếu tập trung. Không ít lần cầu thủ sinh năm 1993 phạm lỗi không cần thiết với đối phương trong vòng cấm, khiến đội nhà phải chịu quả phạt đền.
Đội tuyển Việt Nam 2-4 Đội tuyển Malaysia (Bán kết lượt về AFF Cup 2014)
Ngay phút thứ 3 trong trận Bán kết lượt về AFF Cup 2014 với Malaysia, Quế Ngọc Hải có tình huống đẩy sau với tiền đạo Indra Putra của Malaysia trong vòng cấm. Pha bóng này khiến đội tuyển Việt Nam phải chịu một quả phạt đền. Tiền
Bàn thua sớm cộng với những sai lầm liên tiếp ở hàng phòng ngự khiến thầy trò HLV Miura kết thúc trận đấu với thất bại 2-4, đồng thời dừng bước tại Bán kết AFF Cup 2014 khi bại trận trước Malaysia với tổng tỉ số 4-5.
Quế Ngọc Hải rất thần tượng và thi đấu có phong cách của Sergio Ramos
Đội tuyển Indonesia 2-1 Đội tuyển Việt Nam (Bán kết lượt đi AFF Cup 2016)
Trận Bán kết lượt đi AFF Cup 2016 với Indonesia đánh dấu một ngày thi đấu không tốt của Quế Ngọc Hải. Cầu thủ của Sông Lam Nghệ An mắc lỗi không kèm người trong bàn thua đầu tiên và khiến tuyển Việt Nam phải chịu một quả phạt đền dẫn tới bàn thua thứ hai.
Phút 49, trong đợt tấn công không nguy hiểm của Indonesia, trung vệ sinh năm 1993 chọn sai điểm rơi và để Stefano Lilipaly cướp bóng xâm nhập vòng cấm. Trong nỗ lực truy cản, Hải Quế phạm lỗi với đối phương và Indonesia được hưởng quả phạt đền. Trên chấm 11m, Boas Salossa ghi bàn ấn định chiến thắng 2-1 cho đội chủ nhà.
Những tình huống Quế Ngọc Hải "biếu không" penalty cho đối thủ
Đội tuyển Việt Nam 2-2 Đội tuyển Indonesia (Bán kết lượt về AFF Cup 2016)
Sau khi thủ môn Trần Nguyên Mạnh bị truất quyền thi đấu trong trận Bán kết lượt về AFF Cup 2016, Quế Ngọc Hải trở thành người gác đền bất đác dĩ của đội tuyển Việt Nam.
Ở tình huống đối mặt với tiền đạo Ferdinand Sinaga trong hiệp phụ thứ nhất, Hải Quế có pha phạm lỗi trong vòng cấm sau khi để đối phương dễ dàng vượt qua. Ở quả penalty sau đó, số 15 của tuyển Việt Nam cũng không thể ngăn cản Manahati Lestusen ghi bàn ấn định tỉ số hòa 2-2. Với kết quả này, Indonesia lọt vào chung kết với chiến thắng 4-3 chung cuộc.
Long An 1-2 Sông Lam Nghệ An (vòng 4 V.League 2017)
Trong những phút cuối cuộc chạm trán giữa Long An và Sông Lam Nghệ An tại vòng 4 V.League 2017, trọng tài xác định Quế Ngọc Hải có pha phạm lỗi với Huỳnh Tấn Tài trong vòng cấm và cho đội chủ nhà được hưởng quả phạt đền.
Ở cự ly 11 mét, Ashkanov Apollon rút ngắn tỉ số xuống còn 1-2 cho Long An. Tuy vậy, Sông Lam Nghệ An vẫn bảo toàn được chiến thắng sau khi trận đấu kết thúc và có 3 điểm đầu tiên tại V.League 2017.
Hà Nội FC 2-0 Sông Lam Nghệ An (Vòng 21 V.League 2018)
Trong trận đấu với Hà Nội FC tại vòng 21 V.League 2018, Quế Ngọc Hải khiến Sông Lam Nghệ An phải nhận một quả phạt đền trong hiệp 1. Tứ quả đá phạt của Thành Lương, số 4 của Sông Lam Nghệ An lóng ngóng để bóng chạm tay trong vòng cấm và trọng tài ngay lập tức chỉ tay vào chấm 11m.
Tuy nhiên, thủ môn Vũ Hải đã sửa sai cho trung vệ sinh năm 1993 khi cản phá thành công cú sút sau đó của Oseni.
Than Quảng Ninh 2-2 Sông Lam Nghệ An (Vòng 23 V.League 2018)
Trong cuộc chạm trán Than Quảng Ninh tại vòng 23 V.League 2018 chiều qua, Quế Ngọc Hải một lần nữa khiến Sông Lam Nghệ An phản chịu một quả penalty.
Ở những phút cuối trận, từ một pha treo bóng bổng của Than Quảng Ninh, đội trưởng của Sông Lam Nghệ An kéo ngã tiền đạo Eydison trong vòng cấm địa. Điều đáng nói, hậu vệ Võ Ngọc Đức đã dễ dàng làm chủ tình hình trong pha treo bóng của đối thủ.
Eydison sau đó đã tận dụng thành công cơ hội trên chấm 11m ấn định kết quả hòa 2-2. Sông Lam Nghệ An đánh rơi chiến thắng sau khi đã dẫn trước tới 2-0 trong hiệp 1.
Vdieo Quế Ngọc Hải phạm lỗi và phản ứng với trọng tài ở trận gặp T.Quảng Ninh vòng 23 V.League 2018