Dựa trên thứ bậc trên BXH quần vợt thế giới, hai hạt giống số 1 của US Open năm nay ở giải của nam và nữ lần lượt là Novak Djokovic và Serena Williams.
Sau khi bị loại sớm khỏi Olympic 2016, cả Djokovic lẫn Serena đều đang gặp chấn thương: Djokovic đau cổ tay trái thì Serena có vấn đề về vai phải. Giải đấu tiếp theo của cả 2 sẽ là US Open, Grand Slam cuối cùng trong năm diễn ra từ ngày 29/08.
Với Djokovic, đối thủ lớn nhất tại giải đấu tới vẫn sẽ là Andy Murray – tay vợt đang đạt phong độ với danh hiệu tại Wimbledon và tấm HCV Olympic.
Do Roger Federer không tham dự, hạt giống số 3 thuộc về Stan Wawrinka, trong khi hạt tay vợt hạng 5 thế giới Rafael Nadal được chọn làm hạt giống số 4.
Với chức vô địch tại Cincinnati, Marin Cilic đã nhảy một mạch 5 bậc lên hạng 9 thế giới, cộng với việc Tomas Berdych rút lui, tay vợt từng lên ngôi tại US Open 2014 được xếp là hạt giống số 7.
Ở nội dung của nữ, những hạt giống hàng đầu đáng chú ý ngoài Serena Williams còn có Angelique Kerber (2), Garbine Muguruza (3), Agnieszka Radwanska (4), Simona Halep (5) và Venus Williams (7).
Tay vợt hạ Serena ở bán kết US Open năm ngoái, Roberta Vinci sẽ là hạt giống số 7. Vị trí tiếp theo thuộc về niềm hy vọng mới của quần vợt Mỹ, Madison Keys.
Lễ bốc thăm phân nhánh đấu US Open 2016 được tổ chức vào ngày 26/08, với sự hiện điện của những nhà ĐKVĐ giải đấu: Novak Djokovic và Flavia Penneta.