Ban tổ chức giải đua MotoGP 2017 thông báo họ sẽ tiếp tục áp dụng hệ thống điểm phạt mà đã được thông qua từ năm 2013.
Hệ thống này đã được đưa ra để tạo nên tính thống nhất trong các giải đua và đã được điều chỉnh trong những năm gần đây. Từ khi xảy ra vụ đụng độ giữa Valentino Rossi và Marc Marquez trong trận chung kết 2015, ban quản trị đã đưa thêm hình phạt trừ 4 điểm nếu có đụng độ mang tính chất cố ý.
Một lệnh cấm dành cho tay đua đạt được 10 điểm trong thời gian 12 tháng vẫn được duy trì, tuy nhiên những hình phạt phát sinh từ lúc bắt đầu cuộc đua đã bị bãi bỏ vào năm 2016. Các huấn luyện viên vẫn duy trì phạm vi để phạt những tay đua theo ý của họ. Cụ thể là việc tay đua Andrea Iannone đã đâm vào đuôi xe của Jorge Lorenzo trong vòng đua tại Barcelona và đây là lần phạm lỗi thứ 2 trong sáu vòng đầu của mùa giải.
Với những lựa chọn đó, Ủy Ban Grand Prix đã quyết định sau kì nghỉ của vòng đua Qatar những điểm phạt này là không cần thiết và hệ thống điểm phạt này cần bị loại bỏ ngay lập tức. Các quy tắc về độ an toàn của đường pit cũng đã được tinh chỉnh với đội hỗ trợ gồm 6 thành viên được trang bị những thiết bị an toàn để có thể nhanh chóng thay đổi xe khi cần. Bên cạnh đó tiêu chuẩn về loại mũ bảo hiểm mới cũng là một yêu cầu bắt buộc cho mùa giải năm nay.