Vòng chung kết U17 Quốc gia 2020 diễn ra từ ngày 18/9 đến 27/9 tại Trung tâm đào tạo bóng đá trẻ PVF. Tham dự giải có 8 đội gồm U17 SLNA, U17 Thanh Hóa, U17 HAGL, U17 Phú Yên, U17 Sài Gòn, U17 Đồng Tháp, U17 Học viện Nutifood và U17 PVF.
8 đội được chia thành 2 bảng, mỗi bảng 4 đội thi đấu vòng tròn một lượt để tính điểm, xếp hạng. Hai đội đứng đầu mỗi bảng giành quyền vào vòng bán kết. Hai đội thắng ở bán kết sẽ vào thi đấu trận chung kết tranh ngôi vô địch. Hai đội thua ở bán kết đồng xếp hạng 3.
Ở bảng A, U17 Thanh Hóa chính thức trở thành cựu vương sau khi cán đích ở vị trí thứ 3. Sau 3 lượt trận, đội bóng xứ Thanh có 4 điểm sau 1 trận thắng, 1 trận hòa và 1 trận thua. Hai đội bóng giành vé đi tiếp ở bảng đấu này là U17 PVF (6 điểm) và U17 HAGL (5 điểm).
Ở bảng B, với sự vượt trội của mình, U17 Học viện Nutifood và U17 SLNA chỉ mất 2 lượt trận để ghi tên mình vào vòng đấu dành cho 4 đội xuất sắc nhất. Ở trận đấu phân định ngôi đầu bảng U17 Học viện Nutifood đã đánh bại U17 SLNA với tỷ số 4-2.
Ở trận bán kết đầu tiên, U17 Nutifood đã vượt qua U17 HAGL với tỷ số cách biệt 3-0. Đối thủ của thầy trò Guillermo Graechen là U17 SLNA, đội bóng đã đánh bại chủ nhà U17 PVF sau loạt đấu súng cân não.
Lịch thi đấu chung kết U17 Quốc gia 2020
17h00, 27/9: U17 Học viện Nutifood vs U17 SLNA