Có vẻ như các đội mạnh là An Giang, Đồng Tháp hay Đồng Nai muốn dưỡng sức cho chặng đua quyết định lên Đà Lạt vào ngày 27/4 tới nên đã không chủ động đánh chiếm áo vàng của Nguyễn Trường Tài (VUS TP.HCM) ở chặng 12. Chính vì thế mà diễn biến chặng đua này không có gì đặc biệt. Các đội mạnh chỉ để các tay đua không có thứ hạng cao trên bảng xếp hạng áo vàng, áo xanh và áo đỏ ra đi, khi còn cách đích 20 km, họ chủ động kéo tốp sau bắt lại các tay đua đi đầu để tạo thành đoàn đoàn về đích.
Tại đích đến ở TP. Nha Trang, Nguyễn Thành Tâm (Tập đoàn Lộc Trời An Giang) được các đồng đội đưa vào vị trí thuận lợi để rút thắng Lê Văn Duẩn (VUS TP.HCM), cán đích đầu tiên với thành tích 3h32’51, tốc độ trung bình 36.927 km/g.
Sau chặng 12, các vị trí ở bảng xếp hạng cá nhân và đồng đội vẫn không thay đổi.
Ngày 26/4, các tay đua được nghỉ tự do ở Nha Trang trước khi bước vào chặng đua một ngày sau đó lên Đà Lạt chinh phục đèo Khánh Lê.