Do số lượng ngoại binh và thể thức lên xuống hạng đã được Ban bóng đá chuyên nghiệp quy hoạch từ mùa 2015 đên 2018, hội thảo công tác tổ chức các giải BĐCN Việt Nam 2016 chủ yếu tập trung vào việc tổ chức giải đấu tốt hơn và ngày một chuyên nghiệp.

Từ mùa giải 2015 đến 2018, số lượng ngoại binh vẫn được duy trì theo công thức CLB tham dự giải AFC được đăng ký 3 đá 2, cộng 1 cầu thủ châu Á, các đội bóng còn lại duy trì đăng ký 2 đá 2. Với số lượng lên xuống hạng vẫn tiếp tục được giữ là V.League xuống 1 và hạng Nhất lên 1.

Ở buổi hội thảo này, những vấn đề được đưa ra bàn thảo gồm: Lắng nghe tham luận của công ty Sportrada về đề án cá cược bóng đá và giải pháp phòng chống tiêu cực liên quan đến cá độ; Tham luận của các CLB chuyên nghiệp; Tầm quan trọng của việc xây dựng tốt mối quan hệ giữa đội bóng và địa phương; Kinh nghiệm trong việc phát triển Hội CĐV và thu hút khán giả; Cách thức chấm điểm hỗ trợ kinh phí cho các CLB trong năm 2016 và một số yêu cầu về công tác tài trợ, truyền thông…

Một trong vấn đề quan trọng nữa là các thành viên sẽ thảo luận việc sửa đổi Quy định kỷ luật của VFF, liên quan đến vụ Quế Ngọc Hải – Anh Khoa.