Tháng 9/2021, Văn Hậu gặp chấn thương đầu gối, anh không thể góp mặt trong đợt tập trung của đội tuyển Việt Nam. Hai tháng sau đó, hậu vệ quê Thái Bình đã sang Hàn Quốc phẫu thuật và điều trị chấn thương. 

Trận đấu giữa CLB Hà Nội vs Than Quảng Ninh tại vòng 7 V.League 2020 diễn ra vào ngày 8/11 là lần gần nhất Văn Hậu thi đấu tại giải đấu quốc nội này. Trong khi đó, ở cấp độ đội tuyển quốc gia, Văn Hậu đã ra sân trong cuộc chạm trán đội tuyển Việt Nam vs UAE ở lượt cuối vòng loại thứ 2 World Cup 2022 khu vực châu Á diễn ra vào tháng 6/2021 trước khi gặp chấn thương. Ở trận đấu đó, anh cùng các đồng đội đã để thua với tỉ số 2-3. 

Sau 9 tháng điều trị chấn thương, hậu vệ sinh năm 1999 đã chính thức trở lại thi đấu trong trận đấu tâm điểm vòng 6 V.League 2022 giữa CLB Hà Nội vs CLB Hải Phòng diễn ra vào lúc 19h ngày 10/7 trên SVĐ Hàng Đẫy.

Cụ thể, ở phút thứ 72 khi đội nhà đang dẫn trước với tỉ số 2-1 và chịu sức ép lớn từ đối thủ, BHL CLB Hà Nội đã đưa Văn Hậu vào sân. Trong khoảng 20 phút góp mặt trên sân, cầu thủ này thi đấu năng nổ, hoàn thành vai trò của mình. Kết thúc thời gian thi đấu, Văn Hậu và các đồng đội giành chiến thắng với tỉ số 2-1, vươn lên vị trí thứ hai trên BXH V.League 2022. 

Chia sẻ sau trận đấu, Văn Hậu cho biết: "Thời gian tới tôi cố gắng tập luyện để tốt hơn và mạnh mẽ hơn. Thể trạng của tôi hiện tại tốt. Khi trở lại sân cỏ tôi không cảm thấy bỡ ngỡ vì tôi đã quen với cảm giác ra sân".

"Mục tiêu của tôi là được đá chính và cùng đội bóng giành chiến thắng trong từng trận. Tôi rất vui khi được khán giả đón nhận và mọi người đã chờ đợi tôi rất lâu rồi. Đây là thời điểm tốt đẹp nhất, hi vọng tương lai phía trước sẽ tươi sáng hơn. Hiện tại tôi hồi phục rất tốt, khi vào sân tôi sẽ chơi 100% sức lực", Văn Hậu nói thêm. 

Trước đó, Đoàn Văn Hậu có tên trong danh sách 28 cầu thủ của CLB Hà Nội trong chuyến làm khách tới sân Thiên Trường (Nam Định) và Hòa Xuân (Đà Nẵng). Tuy nhiên, cầu thủ này chưa ra sân thi đấu. Trong thời gian tới, cầu thủ gốc Thái Bình cần tập luyện, thi đấu để tìm lại cảm giác cũng như phong độ tốt nhất. Sự trở lại của Văn Hậu là tín hiệu đáng mừng cho CLB Hà Nội và đội tuyển quốc gia Việt Nam.