Trong danh sách 23 cầu thủ được triệu tập khẩn cấp chuẩn bị cho trận đấu với Scotland thuộc bảng 2, League B có sự góp mặt của Filip Nguyễn. Ngay sau khi đăng tải danh sách này, thủ thành của CLB Slovan Liberec chia sẻ trên trang facebook cá nhân: “Sau khi họp gia đình, tôi đã quyết định sẽ tận dụng cơ hội này. Rất tiếc tôi không thể đợi VFF/Chính phủ Việt Nam cấp quốc tịch mà tôi đã đệ đơn trong vòng 3 năm qua.
Tuy nhiên, sự bắt đầu ở ĐTQG CH Czech sẽ dập tắt cơ hội của tôi chơi cho ĐT Việt Nam. Tôi tin rằng, với quyết định này, NHM sẽ hiểu và cảm ơn tất cả mọi người vì đã ủng hộ”. Filip Nguyễn từng bày tỏ khát khao cống hiến cho ĐT Việt Nam.
Anh cũng có dịp trở về quê cha vào năm 2018 và nỗ lực để có thể có quốc tịch trong thời gian qua. Dù vậy, trước cơ hội không thể tốt hơn cho sự nghiệp là khoác áo tuyển CH Czech, Filip Nguyễn không thể từ chối. Anh sẽ có dịp đối đầu với Scott McTominay (Man United), Kieran Tierry (Arsenal) hay Andrew Robertson (Liverpool) vào rạng sáng ngày 8/9.