Ưu tiên số 1 của Filip Nguyễn vẫn là được khoác áo đội tuyển Việt Nam. Tuy nhiên, anh hiện đang đứng trước lựa chọn khó khăn khi mới đây đã được LĐBĐ Czech triệu tập vào đội tuyển bóng đá quốc gia nước này, dự UEFA Nations League. 

Vấn đề là 2 năm qua, Filip Nguyễn và gia đình đã nỗ lực để nhập quốc tịch Việt Nam, qua đó có thể khoác áo đội tuyển Việt Nam. Mặc dù vậy, tiến độ thực hiện việc này diễn ra quá chậm. Trong trường hợp không nhận được sự hỗ trợ cần thiết từ phía VFF, Filip Nguyễn có thể đánh mất cơ hội cá nhân anh nếu vẫn phải chờ đợi phía Việt Nam, trong khi phía đội tuyển CH Czech đã mở cho anh cơ hội. 

FIFA có quy định về việc một cầu thủ chỉ được khoác áo ĐTQG một nước. Tuy nhiên theo tìm hiểu, quy định sẽ được áp dụng cụ thể tuỳ tính chất giải đấu. Thông tin của Webthethao cho biết, Filip Nguyễn đã làm việc với luật sư để xác định cơ hội khoác áo đội tuyển Việt Nam trong trường hợp ra sân trong màu áo CH Czech ở UEFA Nations League. 

Như Webthethao đã đưa tin, sau trận thắng 3-1 Slovakia, tuyển Czech bị phát hiện có 2 trường hợp dương tính với COVID-19. Toàn đội bị cách ly gồm cả HLV trưởng Jaroslav Silhavy. 

LĐBĐ Czech vì vậy phải triệu tập một đội tuyển mới để chuẩn bị cho trận đấu với Scotland ngày 8/9 tới. Trong số những cái tên được triệu tập có Filip Nguyễn.