Trước lượt trận cuối cùng giải VĐQG CH Czech, Slovan Liberec có quyền tự quyết khi xếp vị trí thứ 4 với 51 điểm, hơn vị trí thứ 5 của Jablonec đúng 1 điểm. Theo thể thức thi đấu của giải đấu này, hai đội đứng đầu giành vé dự Champions League, hai đội xếp thứ 3 và 4 dự Europa League; đội thứ 5 tranh vé vớt còn lại dự Europa League với đội “vô địch” nhóm vị trí thứ 7 đến 10.
Cánh cửa đến với Europa League khá rộng mở với Filip Nguyễn và đồng đội. Ở trận cuối gặp Viktoria Plzen, Slovan Liberec sẽ giành vé đi thẳng Europa League nếu có trọn vẹn 3 điểm. Filip Nguyễn sau hai trận bị bỏ quên trên băng ghế dự bị trở lại đội hình thi đấu.
Tuy vậy, Viktoria dù đã có vé dự Champions League nhưng thể hiện sức mạnh vượt trội. Họ nhanh chóng đè bẹp đối thủ với tỷ số 4-0. Slovan Liberec đành trông chờ vào kết quả cặp đấu còn lại giữa Jablonec vs Banik Ostrava.
Kết quả chung cuộc, hai đội hòa nhau với tỷ số 1-1. Giành một điểm, Jablonec có cùng 51 điểm như Slovan Liberec. Đội bóng của Filip Nguyễn có chỉ số hiệu số bàn thắng/thua vượt trội khi +4 so với -4 của Jablonec. Xét về chỉ số đối đầu trong mùa giải, Slovan Liberec tốt hơn đối thủ khi thắng 1, hòa 2. Thế nhưng, đội bóng của Filip Nguyễn vẫn phải ngậm ngùi xếp sau Jablonec. Bởi lẽ, ở giai đoạn 1, họ xếp thứ 5 trong khi đối thủ xếp thứ 4.
Cay đắng đánh mất tấm vé dự thẳng Europa League, Slovan Liberec phải trải qua trận play-off với Mlada Boleslav để tranh tấm vé cuối cùng đến sân chơi lớn thứ 2 châu Âu. Trận đấu này diễn ra vào ngày 12/7.