HLV Park Hang Seo đã cho phép Đoàn Văn Hậu sớm rời ĐT Việt Nam để chuyên tâm vào việc chữa trị chấn thương. Theo đó, hậu vệ thuộc biên chế câu lạc bộ Hà Nội đã liên tục gặp vấn đề về sức khoẻ trong 2 năm qua.
Thời điểm tháng 3/2020 khi còn khoác áo Heerenveen, Văn Hậu được ra sân thi đấu trong trận gặp Jong Willem II ở giải bóng đá dành cho các đội dự bị Hà Lan. Ngay phút 16, hậu vệ sinh năm 1999 không may gặp chấn thương sau một pha nỗ lực cản phá bóng. Anh được xác định bị giãn cơ, xương nhưng may mắn dây chằng không tổn thương.
Đến đầu tháng 8, Văn Hậu trở về thi đấu cho Hà Nội FC. Tuy nhiên, cầu thủ này tiếp tục đối diện với chấn thương dù chỉ mới tập luyện và chưa thi đấu trận nào tại V.League. Thời điểm đó, anh được chẩn đoán phù dây chằng chéo trước, chéo sau và gân cơ kheo. Ngoài ra còn bị dập sừng sau sụn chêm trong, sừng trước sụn chêm ngoài độ 1 ở đầu gối phải.
Sau 3 tháng điều trị, HLV Chu Đình Nghiêm đã sử dụng Văn Hậu trong 2 trận đấu cuối cùng của Hà Nội FC tại V.League 2021, trong đó thi đấu trọn vẹn 90 phút trận gặp Sài Gòn và 45 phút trận đối đầu Than Quảng Ninh.
Tưởng chừng như Văn Hậu đã hồi phục hoàn toàn để chuẩn bị cho đợt tập trung ĐT Việt Nam cuối năm 2020 thì bất ngờ hậu vệ này lại tái phát chấn thương. Lần này, Hậu bị mẻ sụn chêm đầu gối do ảnh hưởng từ chấn thương cũ và buộc phải tiến hành phẫu thuật tại TPHCM.
Tháng 1/2021, anh có mặt tại Trung tâm đào tạo bóng đá trẻ PVF để thực hiện quá trình vật lý trị liệu. Trong hơn 4 tháng tập hồi phục, cầu thủ này trải qua một số cuộc hội chẩn của các bác sĩ đầu ngành tại VFF, trung tâm PVF, bệnh viện Bạch Mai và bệnh viện Việt Đức.
Tháng 5 vừa qua trước khi hoàn thành quá trình điều trị tại trung tâm phục hồi chức năng PVF, đội ngũ y tế tại đây từng đưa ra cảnh báo rằng Văn Hậu tiếp tục phải duy trì tập luyện theo phác đồ điều trị với khối lượng điều chỉnh tăng dần, đặc biệt là cần được theo dõi tình trạng gối để tráng bị quá tải. Thế nhưng, anh vẫn được HLV Park triệu tập và thi đấu trong cả 3 trận đấu tại vòng loại World Cup 2022 trên đất UAE.
Trở về Hà Nội FC, Văn Hậu lại một lần nữa tái phát chấn thương. Trong ngày hội quân tuyển Việt Nam hồi đầu tháng 8, anh xuất hiện với đôi chân tập tễnh, di chuyển khó khăn. Thời gian đầu chỉ tập gym tại khách sạn để chờ bác sĩ Choi Ju Yong trở lại Việt Nam. Dù vậy, sau khi có sự can thiệp của "thần y" Hàn Quốc trong những ngày tập luyện vừa qua, tình trạng của Hậu vẫn không có nhiều tiến triển.
Văn Hậu chính thức chia tay ĐT Việt Nam để tiếp tục điều trị chấn thương. Nhiều người đã đặt ra câu hỏi vì sao Văn Hậu liên tục chấn thương và bao giờ anh mới có thể bình phục hoàn toàn.