Tham dự giải bóng đá nữ VĐQG Việt Nam 2020 có 8 đội gồm: Phong Phú Hà Nam, TKS Việt Nam, Sơn La, Thái Nguyên T&T, Hà Nội 1, Hà Nội 2, TPHCM 1 và TPHCM 2.
Đáng chú ý, sau khi tìm được nguồn kinh phí hoạt động mới, Hà Nội 2 đã quay trở lại với lứa cầu thủ mới tài năng. Sự góp mặt của đội bóng này giúp mỗi lượt trận sẽ có 4 trận đấu diễn ra, nhiều hơn 1 trận so với một lượt đấu ở mùa giải năm ngoái.
Giải năm nay thi đấu theo thể thức lượt đi - lượt về tính điểm xếp hạng. Lượt đi diễn ra từ 22/9 đến 13/10/2020, tại hai địa điểm SVĐ Hà Nam và Trung tâm tâm đào tạo bóng đá trẻ Việt Nam. Lượt về dự kiến diễn ra từ ngày 20/11 đến 11/12/2020, tại TPHCM.
So với các giải đấu của nam, giải VĐQG nữ thi đấu tập trung ở một đến 2 địa điểm nên việc tổ chức, quản lý và kiểm tra dịch bệnh nhằm đảm bảo an toàn cho các thành viên thuận lợi hơn nhiều.
Giống như năm ngoái, giải năm nay tiếp tục áp dụng quy định mỗi đội được phép thay thế tối đa 5 cầu thủ trong tối đa 3 lần thay.